25
марта
2018

Расшифрованы полноразмерные геномы двух штаммов вируса Парамушир, которые изолированы из Ixodes uriae, собранных в гнёздах тонкоклювых кайр в ходе проекта по возобновлению эколого-вирусологических экспедиций на о. Тюлений (2015-2017 гг.)

Более трёх десятилетий назад, в конце 1980‑х гг., в СССР были прекращены регулярные исследования арбовирусов, связанных с Ixodes uriae White, 1852 (Acari: Ixodidae) в колониях морских птиц на малых островах в акватории Охотского и Берингова морей. В настоящее время, Лаборатория вирусологии ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН успешно продолжает эти исследования в сотрудничестве со Школой биомедицины ДВФУ, ННЦ морской биологии ДВО РАН и Федеральной службой Роспотребнадзора. В частности, методом высокопроизводительного секвенирования получены нуклеотидные последовательности полноразмерных геномов двух штаммов вируса Парамушир (PMRV – Paramushir virus) (Bunyaviridae, Nairovirus, антигенная группа Сахалин), которые изолированы из пулов I. uriae, собранных в гнёздах тонкоклювых кайр (Uria aalge Pontopiddan, 1763) на о. Тюлений (близь сахалинского м. Терпения). До сих пор был известен единственный полноразмерный сиквенс российского штамма, изолированного в 1972 г.: Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю. и др.. Вопросы вирусологии. 2014 59(3):11–17.
Результаты направлены в Journal of Virology. После опубликования статьи последовательности нуклеиновых кислот станут доступны в международной базе данных GenBank. Исследования выполнены при поддержке Проекта "Дальний Восток" № 18-5-060 и РНФ-17-74-20096.